Al occidente, en la región circunlacustre y perivolcánica, subsisten nombres de origen mexicano, dejados por tribus chorotegas y nahuas. Entre los primeros mencionados, por ejemplo: Momotombo, Nagarote, Mateare, Masaya, Nindirí, Niquinohomo, Diriamba, Nandaime, etc. Los nombres náhuatl más recientes aparecen en Managua: Asososca, Tiscapa, Nejapa, Chiltepe, Masatepe, Tipitapa, Chinandega y otros lugares, así como a lo largo de la ruta comercial establecida por los aztecas en el centro de Nicaragua, donde están Jalapa, Telpaneca, Condega, Sébaco, Teustepe y Juigalpa, entre otros.

Los dos grandes lagos fueron llamados Cocibolca y Xolotlán, según el culto tolteca, en honor a los gemelos míticos Quetzalcóalt y Xolotl, llevados a Nicaragua por los sobrevivientes de Tula. Un grupo aparte son los indios sutiabas o maribios, cuyos descendientes hoy subsisten muy transformados en un barrio aledaño a la ciudad de León. Los primitivos habitantes de la región montañosa central de Nicaragua han sido indistintamente llamados chontales, matagalpas o populucas.

Su raza y lengua se mezclaron con el español durante el mestizaje; solamente quedan algunas toponimias como Palacagüina, Somoto, Yalí, Susucayán, Saraguasca, Wiwilí, Limay, Moropotente, Oluma, Lóvago, etc. En la región del Caribe de Nicaragua, localmente conocida como la Costa Atlántica, viven las tribus de los mískitos, sumus y ramas. Son nombres mískitos: Kukalaya, Alamikamba, Layasiksa, Raitipura, Tasbaprí, Dakura, Bismuna, Bambana, etc. De los sumos derivan Paiwas, Matiguás, Pancasán, Kilambé, Musún, Kukra, Kurinwás, Waspam, Bocay, etc. De los ramas proceden Yolaina, Melchora, Silico, Chiripa, y están emparentados étnicamente con los grupos chibcha-muiscas del norte de Sudamérica.

El resto de las toponimias se han introducido como resultado de tres siglos de dominación española, en la mitad occidental del país. En la Costa Atlántica, a su vez, los ingleses ejercieron hegemonía, y la influencia británica se hizo sentir hasta finales del siglo pasado, en 1894. De ahí derivan nombres como Bluefields, Corn Island, Pearl Lagoon, Monkey Point, Sandy Bay y otros semejantes.